Juan Miguel era mueblista, militante del Partido Comunista y fue detenido el 11 de septiembre de 1973 en la ciudad de Los Angeles por funcionarios de la Policía de Investigaciones de esa ciudad. Fue conducido al Liceo de Hombres de Los Angeles, recinto a cargo de militares y destinado en ese entonces, para reclusión. De ahí fue trasladado en algún momento hasta el regimiento de Infantería de Montaña, allí pudo verlo su esposa Según el Informe de la Comisión Nacional de Verdad y Reconciliación, Juan Miguel Yáñez Franco, luego de haber sido detenido en su domicilio, fue trasladado en algún momento hasta el Regimiento de Infantería de Montaña N°17 de Los Angeles, lugar en el cual fue visitado por su cónyuge, y desde donde fue sacado con destino desconocido hasta hoy.
