Fue detenido el día 19 de septiembre de 1973, alrededor de las 23:00 horas, en su domicilio de la Hacienda Polcura, Los Angeles, por efectivos de Carabineros de la Tenencia El Abanico. Antes de llevarse a Benjamín Orrego procedieron a allanar la vivienda, en presencia de su cónyuge Ana Pérez Osses y otros familiares. Al ser consultado, el Suboficial Nelson Arriagada quien estaba al mando de la informó que el detenido sería llevado a la Tenencia El Abanico. Al día siguiente, su mujer concurrió al mencionado recinto policial, donde un carabinero de Guardia le manifestó que Orrego había sido fusilado en el camino, antes de llegar a la Tenencia.
