Era el Jefe de la Dirección de Industria y Comercio de Temuco (DIRINCO), tenía 23 años, y era Técnico Agrícola. El día 13 de septiembre salió de la ciudad rumbo a Parral para pasar las fiestas patrias con su familia; sus primos relatan que en ese entorno familiar se discutió que era lo que debía hacer ante el requerimiento de presentarse ante las nuevas autoridades. José decide volver a Temuco y recurrir a su íntimo amigo el Teniente de Carabineros Italo García Watson; junto a él se presenta voluntariamente el 19 de septiembre de 1973 en la Comisaria de Carabineros de Temuco. Al no tener noticias, su familia recurre al mismo García Watson quien les confirma que José Isaias San Martín Benavente, luego de entregarse voluntariamente, había sido fusilado.